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海曲泊帕和阿伐曲泊帕都是小分子非肽类TPO受体激动剂，能与TPO受体的跨膜结构域相互作用，刺激骨髓巨核系的增殖和分化，从而促进血小板的生成。然而，阿伐曲泊帕的结构中不含酰肼结构，而是含有苯并噻唑结构，这种结构不易与金属阳离子发生螯合。因此，阿伐曲泊帕可以随餐服用，血药浓度和药效不受食物影响。相比之下，海曲泊帕需要空腹服用，以避免与含有金属离子的食物或药物同时摄入。
阿伐曲泊帕的生物利用度高达100%，意味着口服后的药物全部被吸收。而海曲泊帕的生物利用度较低，仅为38%，说明有一部分药物在口服后未被吸收。阿伐曲泊帕的半衰期为7-9小时，药效持久。相比之下，海曲泊帕的半衰期为2-3小时，药效相对较短。
阿伐曲泊帕的稳态血药浓度为1.5-3.0 ng/mL，能够有效刺激血小板生成。而海曲泊帕的稳态血药浓度较低，为0.3-0.8 ng/mL。
阿伐曲泊帕主要用于治疗择期行诊断性操作或手术的慢性肝病相关血小板减少症的成年患者。而海曲泊帕则适用于因血小板减少和临床条件导致出血风险增加的既往对糖皮质激素、免疫球蛋白等治疗反应不佳的慢性原发免疫性血小板减少症(ITP)成人患者。
两者在治疗各自适应症方面均表现出较好的疗效，但具体哪个更优需要根据患者的具体情况和临床医生的判断。
两种药物在使用过程中都可能产生一定的副作用，如头痛、恶心等。然而，阿伐曲泊帕由于不受食物影响，患者用药依从性可能相对较好。
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