使用普纳替尼（Ponatinib）最常见的不良反应是皮疹和相关症状、关节痛、腹痛、头痛、便秘、皮肤干燥、高血压、疲劳、液体潴留和水肿、发热、恶心、胰腺炎/脂肪酶升高、出血、贫血、肝功能异常和AOE。经上市后普纳替尼出现的不良反应包括血栓性微血管病、甲状腺机能亢进、胃肠穿孔（瘘）、脱水、可逆性后部白质脑病综合征(RPLS)、严重的皮肤反应(如多形红斑、史蒂文斯-约翰逊综合征)、伤口愈合受损、动脉(包括主动脉)动脉瘤、夹层和破裂。
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