在阿那格雷（Anagrelide）的临床研究中，普通的副作用头痛、腹泻、异常虚弱/疲劳、脱发、恶心；严重不良反应包括充血性心力衰竭、心肌梗死、心肌病、心脏扩大、完全性心脏传导阻滞、房颤、脑血管意外、心包积液、胸腔积液、肺浸润、肺纤维化、肺动脉高压和胰腺炎；导致治疗中断的最常见不良反应是头痛、腹泻、水肿、心悸和腹痛。由于这些问题，阿那格雷通常不应被视为原发性血小板增多症的一线治疗。
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